MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-8

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020377	ATT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202002
2	NC_020377	ATC	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202002
3	NC_020377	AT	3	6	320	325	50 %	50 %	0 %	0 %	452202002
4	NC_020377	GAC	2	6	392	397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202002
5	NC_020377	TAC	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202002
6	NC_020377	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	452202002
7	NC_020377	ATT	2	6	875	880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202003
8	NC_020377	A	7	7	898	904	100 %	0 %	0 %	0 %	452202003
9	NC_020377	A	6	6	1005	1010	100 %	0 %	0 %	0 %	452202003
10	NC_020377	AGAA	2	8	1018	1025	75 %	0 %	25 %	0 %	452202003
11	NC_020377	AAC	2	6	1046	1051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202003
12	NC_020377	ACT	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202003
13	NC_020377	A	6	6	1122	1127	100 %	0 %	0 %	0 %	452202003
14	NC_020377	ACT	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202003
15	NC_020377	TAAC	2	8	1146	1153	50 %	25 %	0 %	25 %	452202003
16	NC_020377	A	6	6	1248	1253	100 %	0 %	0 %	0 %	452202004
17	NC_020377	CAAA	2	8	1265	1272	75 %	0 %	0 %	25 %	452202004
18	NC_020377	TATT	2	8	1280	1287	25 %	75 %	0 %	0 %	452202004
19	NC_020377	TAA	2	6	1363	1368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202004
20	NC_020377	GA	3	6	1403	1408	50 %	0 %	50 %	0 %	452202004
21	NC_020377	CT	3	6	1436	1441	0 %	50 %	0 %	50 %	452202004
22	NC_020377	T	6	6	1791	1796	0 %	100 %	0 %	0 %	452202005
23	NC_020377	TA	3	6	1822	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	452202005
24	NC_020377	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202005
25	NC_020377	A	7	7	1959	1965	100 %	0 %	0 %	0 %	452202005
26	NC_020377	A	7	7	2202	2208	100 %	0 %	0 %	0 %	452202006
27	NC_020377	TACT	2	8	2220	2227	25 %	50 %	0 %	25 %	452202006
28	NC_020377	TTTC	2	8	2241	2248	0 %	75 %	0 %	25 %	452202006
29	NC_020377	A	7	7	2254	2260	100 %	0 %	0 %	0 %	452202006
30	NC_020377	TC	3	6	2291	2296	0 %	50 %	0 %	50 %	452202006
31	NC_020377	ATC	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202007
32	NC_020377	CAC	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202007
33	NC_020377	TTC	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202007
34	NC_020377	T	6	6	2461	2466	0 %	100 %	0 %	0 %	452202007
35	NC_020377	TCA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202008
36	NC_020377	TAA	2	6	2596	2601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
37	NC_020377	T	6	6	2652	2657	0 %	100 %	0 %	0 %	452202008
38	NC_020377	CCA	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202008
39	NC_020377	AATT	2	8	2688	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	452202008
40	NC_020377	TAAA	2	8	2712	2719	75 %	25 %	0 %	0 %	452202008
41	NC_020377	TTC	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202008
42	NC_020377	AAT	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
43	NC_020377	ATA	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
44	NC_020377	TAT	2	6	3029	3034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202008
45	NC_020377	TTC	2	6	3045	3050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202008
46	NC_020377	AAT	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
47	NC_020377	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202008
48	NC_020377	GTC	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202008
49	NC_020377	A	7	7	3214	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	452202008
50	NC_020377	CTTT	2	8	3227	3234	0 %	75 %	0 %	25 %	452202008
51	NC_020377	CAT	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202008
52	NC_020377	TAC	2	6	3392	3397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202008
53	NC_020377	CTCA	2	8	3423	3430	25 %	25 %	0 %	50 %	452202008
54	NC_020377	T	6	6	3431	3436	0 %	100 %	0 %	0 %	452202008
55	NC_020377	AAC	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202009
56	NC_020377	TC	3	6	3991	3996	0 %	50 %	0 %	50 %	452202009
57	NC_020377	TCA	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202009
58	NC_020377	CAAA	2	8	4080	4087	75 %	0 %	0 %	25 %	452202009
59	NC_020377	TCT	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
60	NC_020377	TCTAA	2	10	4160	4169	40 %	40 %	0 %	20 %	452202009
61	NC_020377	AATT	2	8	4180	4187	50 %	50 %	0 %	0 %	452202009
62	NC_020377	T	6	6	4207	4212	0 %	100 %	0 %	0 %	452202009
63	NC_020377	CTT	2	6	4266	4271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
64	NC_020377	CTT	2	6	4347	4352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
65	NC_020377	T	6	6	4351	4356	0 %	100 %	0 %	0 %	452202009
66	NC_020377	CTT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
67	NC_020377	CAA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202009
68	NC_020377	TCAT	2	8	4430	4437	25 %	50 %	0 %	25 %	452202009
69	NC_020377	AGG	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202010
70	NC_020377	A	6	6	4934	4939	100 %	0 %	0 %	0 %	452202010
71	NC_020377	ACT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202010
72	NC_020377	GAA	2	6	5050	5055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202010
73	NC_020377	A	7	7	5073	5079	100 %	0 %	0 %	0 %	452202010
74	NC_020377	A	7	7	5083	5089	100 %	0 %	0 %	0 %	452202010
75	NC_020377	GGA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202011
76	NC_020377	TA	3	6	5234	5239	50 %	50 %	0 %	0 %	452202011
77	NC_020377	TTA	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202011
78	NC_020377	CAA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202011
79	NC_020377	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202011
80	NC_020377	CAAA	2	8	5448	5455	75 %	0 %	0 %	25 %	452202011
81	NC_020377	AAG	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202011
82	NC_020377	GTA	2	6	5549	5554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202011
83	NC_020377	GAA	2	6	5573	5578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202011
84	NC_020377	TCA	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202011
85	NC_020377	A	7	7	5625	5631	100 %	0 %	0 %	0 %	452202011
86	NC_020377	ATT	2	6	5788	5793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202012
87	NC_020377	ATC	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202012
88	NC_020377	TTCA	2	8	5888	5895	25 %	50 %	0 %	25 %	452202012
89	NC_020377	ATC	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202012
90	NC_020377	ATT	2	6	6002	6007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202012
91	NC_020377	AAT	2	6	6061	6066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202012
92	NC_020377	TC	3	6	6105	6110	0 %	50 %	0 %	50 %	452202013
93	NC_020377	CTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202013
94	NC_020377	TGT	2	6	6166	6171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202013
95	NC_020377	TTGT	2	8	6183	6190	0 %	75 %	25 %	0 %	452202013
96	NC_020377	TCA	3	9	6220	6228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202013
97	NC_020377	ATC	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202013
98	NC_020377	CTTC	2	8	6374	6381	0 %	50 %	0 %	50 %	452202013
99	NC_020377	TC	3	6	6392	6397	0 %	50 %	0 %	50 %	452202013
100	NC_020377	A	6	6	6424	6429	100 %	0 %	0 %	0 %	452202013
101	NC_020377	TA	3	6	6440	6445	50 %	50 %	0 %	0 %	452202013
102	NC_020377	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202013
103	NC_020377	AATCTT	2	12	6465	6476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202013
104	NC_020377	AGA	2	6	6516	6521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202013
105	NC_020377	TCT	2	6	6550	6555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202013
106	NC_020377	AATC	2	8	6557	6564	50 %	25 %	0 %	25 %	452202013
107	NC_020377	GAC	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202013
108	NC_020377	TTTC	2	8	6671	6678	0 %	75 %	0 %	25 %	452202013
109	NC_020377	TTG	2	6	6705	6710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202013
110	NC_020377	CT	3	6	6769	6774	0 %	50 %	0 %	50 %	452202013
111	NC_020377	TTTC	2	8	6788	6795	0 %	75 %	0 %	25 %	452202013
112	NC_020377	A	6	6	6846	6851	100 %	0 %	0 %	0 %	452202013
113	NC_020377	T	6	6	6914	6919	0 %	100 %	0 %	0 %	452202013
114	NC_020377	TTCTC	2	10	6949	6958	0 %	60 %	0 %	40 %	452202013
115	NC_020377	A	6	6	6973	6978	100 %	0 %	0 %	0 %	452202013
116	NC_020377	A	6	6	7021	7026	100 %	0 %	0 %	0 %	452202013
117	NC_020377	GAAC	2	8	7056	7063	50 %	0 %	25 %	25 %	452202013
118	NC_020377	AACA	2	8	7064	7071	75 %	0 %	0 %	25 %	452202013
119	NC_020377	ACA	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202013
120	NC_020377	ATT	2	6	7129	7134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202013
121	NC_020377	CTTTT	2	10	7148	7157	0 %	80 %	0 %	20 %	452202013
122	NC_020377	CGTT	2	8	7185	7192	0 %	50 %	25 %	25 %	452202013
123	NC_020377	AAT	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202013
124	NC_020377	CTTT	2	8	7219	7226	0 %	75 %	0 %	25 %	452202013
125	NC_020377	ACA	2	6	7716	7721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202014
126	NC_020377	T	7	7	7767	7773	0 %	100 %	0 %	0 %	452202014
127	NC_020377	T	7	7	7798	7804	0 %	100 %	0 %	0 %	452202014
128	NC_020377	ACT	2	6	7816	7821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202014
129	NC_020377	ATT	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202014
130	NC_020377	T	7	7	7841	7847	0 %	100 %	0 %	0 %	452202014

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.